在申请马来西亚MDA认证过程中，是否需要进行制造工厂的审核取决于多种因素，包括产品类型、认证机构的要求以及产品的风险等级。针对一次性使用纤维环缝合器这类医疗器械，是否需要进行制造工厂审核可能因具体情况而异。

一般来说，一次性使用的医疗器械通常不需要进行制造工厂的现场审核，因为这些产品不需要进行生产过程的监控，而且其制造过程相对较简单。但是，虽然不需要现场审核，你仍然需要向认证机构提供有关制造工厂的相关信息，例如质量管理体系、生产流程、材料采购等。

最终是否需要制造工厂审核，还需与具体的认证机构进行沟通，以确保你了解所有的认证要求。建议在申请认证之前，与专业的医疗器械认证顾问或认证机构联系，获得准确的信息和指导，确保你的申请过程顺利进行。