越南VNMDAe认证的审核机构通常会通过以下方式评估医疗器械制造商的合规性：

文件审查: 审核机构会要求制造商提交详细的技术文件和质量管理体系文件，包括产品规格、设计文件、生产过程控制文件、质量控制记录等。这些文件将被用来评估产品是否符合越南的技术要求和法规。

现场审核: 审核机构会进行现场访查，检查制造商的生产设施和质量管理系统。这包括生产线的实际操作、设备的维护和校准、原材料的使用和控制、产品测试和检验的程序等。

质量管理体系评估: 审核机构会评估制造商的质量管理体系是否符合国际标准（如ISO 13485）或越南国内的相关标准要求。这包括制造商的组织结构、人员培训、文件控制、不良品管理、改进措施等方面的审查。

产品测试和评估: 审核机构可能会要求进行产品样品的测试和评估，确保产品的安全性、有效性和性能符合要求。这些测试可能包括生物兼容性测试、电磁兼容性测试、性能测试等。

法规和标准符合性: 审核机构会检查制造商的产品是否符合越南的法律法规和技术标准要求，确保产品在越南市场上的合法性和合规性。

通过这些评估步骤，审核机构能够全面地评估医疗器械制造商的合规性，确保其生产的产品符合VNMDAe认证的要求，从而保证产品在越南市场上的安全和合法性。