根据欧洲联盟医疗器械监管框架，PET扫描仪被归类为IIb类医疗器械。在MDR法规下，CE认证申请的具体流程如下：

确定适用的技术规范和标准，例如EN 60601-1（通用安全标准）、EN 60601-1-2（电磁兼容性）和EN 60601-2-64（PET扫描仪）等。

选择一家认证机构进行申请，该机构必须经过欧洲联盟指定的认可机构认可。

进行技术文件评估，该评估应包括PET扫描仪的设计、制造、性能特征、使用说明等内容。

进行PET扫描仪的类型试验和生产质量保证系统的审核，以确保产品符合相关技术规范和标准。

完成申请后，如果满足所有要求，认证机构将颁发CE认证证书，该证书有效期为5年。

PET扫描仪的制造商需要确保其产品符合MDR法规下的法律要求，并负责对其产品进行持续的监测和更新，以确保其符合蕞新的技术规范和标准。

请注意，以上仅为一般性的流程说明，具体申请流程可能会因申请人和产品类型而有所不同。建议制造商在申请CE认证前咨询专业机构或律师。

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