小型压力蒸汽灭菌器的MDR CE认证申报流程包括以下步骤：

1. 确定设备分类：首先，确定小型压力蒸汽灭菌器的设备分类，以确定适用的MDR法规和要求。根据设备的风险级别和使用目的，MDR将医疗器械分为不同的等级。

2. 确定技术文件要求：根据设备的分类和MDR要求，确定需要准备的技术文件的内容和格式。技术文件通常包括以下内容：

   - 产品描述和规格。

   - 设计和制造信息。

   - 材料和组件的详细信息。

   - 性能测试数据和结果。

   - 安全性和有效性评估报告。

   - 使用说明书和操作手册。

   - 标签和包装材料。

3. 委托认证机构：选择一家经认可的认证机构进行认证。确保认证机构具有MDR认证的资质和经验。

4. 编制技术文件：根据MDR要求，准备符合认证要求的技术文件。文件需要详细描述设备的设计、性能、制造过程和质量控制等信息，并包括必要的测试数据和报告。

5. 进行风险评估：根据MDR要求，进行风险评估并采取相应的风险控制措施。风险评估应基于ISO 14971标准或类似方法进行。

6. 提交申请和技术文件：将申请表格、技术文件和相关文件提交给认证机构。确保文件的准确性、完整性和及时性。

7. 认证审核和评估：认证机构将对申请文件进行审核和评估。这可能包括文件审查、现场检查和性能测试等。认证机构可能会要求补充信息或进行进一步的评估。

8. 获得CE认证：如果认证机构确认您的小型压力蒸汽灭菌器符合MDR要求，您将获得CE认证。认证机构将颁发认证证书，并将您的设备列入欧洲市场上的公共数据库中。

请注意，具体的MDR CE认证申报流程可能会因产品的特性和分类而有所不同。建议您与的医疗器械顾问或认证机构联系，以获取新的认证指南和准确的申报要求。