立式压力蒸汽灭菌器的MDR CE认证申报流程通常包括以下步骤：

1. 准备技术文件：准备立式压力蒸汽灭菌器的技术文件，包括产品的技术规格、设计文件、性能验证报告、材料和组件的规格等。确保文件完整、准确，并符合欧盟医疗器械法规的要求。

2. 确定技术文件的评估路线：根据产品的分类和特性，确定适用的技术文件评估路线。MDR对医疗器械的分类和评估要求有所变化，您可能需要参考MDR的分类指南和相关指南文件。

3. 选择认证机构：选择一家获得欧洲认可的认证机构进行MDR CE认证。确保认证机构具有相关的资质和经验，并能够评估您的产品类别。

4. 提交申请：向选择的认证机构提交认证申请，包括技术文件和其他所需的文件。认证机构将评估您的申请并与您进行进一步的沟通。

5. 文件评审和审核：认证机构将评审您的技术文件，包括设计文件、性能验证报告等。他们可能会要求您提供进一步的信息或进行现场审核。

6. 现场审核：认证机构可能进行现场审核，以验证产品的符合性和制造过程的合规性。这可能包括访问您的制造工厂、检查质量管理体系等。

7. 认证决定和证书颁发：认证机构根据评审和审核的结果做出认证决定，并颁发CE证书。该证书确认您的立式压力蒸汽灭菌器符合MDR CE认证要求。

请注意，MDR CE认证的申报流程可能会因产品的特性和认证机构的要求而有所不同。建议您与选择的认证机构进行详细的沟通和咨询，以了解他们的具体要求和流程。