要申请动态葡萄糖连续监测系统在欧洲的MDR（医疗器械监管法规）CE认证，您需要按照以下步骤进行办理：

评估产品分类：确定动态葡萄糖连续监测系统的产品分类，根据MDR的规定，医疗器械被划分为不同的分类，不同分类的产品要求和程序可能有所不同。

确定技术文件要求：根据MDR要求，准备和整理完整的技术文件，包括产品描述、设计和制造过程、性能特征、安全性和有效性评估等内容。

确定合规评估程序：根据产品的分类和MDR的要求，确定适用的合规评估程序。通常情况下，高风险类别的医疗器械需要进行第三方的审核，低风险类别的产品可以通过自我评估程序进行认证。

执行合规评估：根据所选择的合规评估程序，执行相应的评估步骤。这可能包括产品测试、性能验证、临床评价和文件审查等过程。

编制技术文件和申请表格：根据欧洲相关机构的要求，编制技术文件，包括技术文件概要、风险分析报告、性能评估报告等。同时，填写申请表格，提供有关产品和制造商的详细信息。

委托认证机构进行评估：将技术文件和申请表格提交给认证机构，由其进行评估和审查。认证机构将对文件的完整性、合规性和安全性进行评估。

监督评估和审核：认证机构可能会进行现场访察或审查技术文件的详细内容，确保产品符合MDR的要求。

发放CE认证：如果动态葡萄糖连续监测系统符合MDR的要求，认证机构将颁发CE认证证书，确认产品符合欧洲市场的安全性和有效性要求。