要申请医用膜分离制氧系统的美国FDA认证，您可以按照以下步骤进行：

确定产品分类：确定医用膜分离制氧系统的产品分类，例如是否属于医疗器械类别。

准备技术文件：收集和准备与医用膜分离制氧系统相关的技术文件，包括设计文件、制造工艺、材料清单、性能测试报告、质量控制计划等。

提交预市场通知（Premarket Notification）：根据产品分类，可能需要提交510(k)预市场通知或PMA（前期批准）申请。对于510(k)申请，您需要比对您的产品与FDA已经批准的类似产品的相似性，并提供充分的科学和技术依据来证明您的产品的安全性和有效性。

审核和审批：FDA将对您的申请进行审核和审批。他们会评估您的技术文件、临床数据（如果适用）、风险评估和其他相关信息，以确定您的产品是否符合FDA的要求。

认证和注册：如果您的申请获得FDA的批准，您将获得相应的认证和注册，允许您在美国市场上销售和使用医用膜分离制氧系统。