要办理血液透析机用水处理设备的欧洲MDR CE认证，可以按照以下步骤进行：

确定CE认证类别：根据设备的风险等级和规模，确定适用的CE认证类别。水处理设备通常属于类别 IIa、IIb 或 III。

准备技术文件：编制符合欧洲MDR要求的技术文件，包括设备的技术规格、设计和制造过程的描述、性能验证和测试报告、使用说明书等。

实施质量管理体系：确保在生产过程中符合欧洲MDR要求的质量管理体系，例如ISO 13485认证。

进行性能评估：根据设备的类别和规模，进行必要的性能评估，可能包括实验室测试、临床评估或临床试验。

委托认证机构进行评估：选择一家合格的认证机构，向其提交申请并委托其进行设备的评估和审核。

技术文件评估：认证机构将对技术文件进行评估，包括性能数据、质量管理体系和符合性文件的审核。

厂审（如果适用）：对制造商的生产工厂进行审查，确保其符合欧洲MDR的要求。

验证和监督：认证机构可能会要求进行现场验证和监督，以确保设备的质量和符合性。

发布CE证书：通过认证机构的评估和审核后，如果设备符合欧洲MDR要求，认证机构将发布CE证书。