办理心肺转流系统用离心泵的欧洲MDR CE认证通常需要遵循以下步骤：

确定产品分类：首先，确定心肺转流系统用离心泵的产品分类，并确认适用的欧洲医疗器械法规（Medical Device Regulation，MDR）。

准备技术文件：根据欧洲MDR的要求，准备以下技术文件：

技术规格文件：提供产品的详细技术规格、设计图纸、制造工艺、材料规格和性能参数等。

风险评估文件：进行产品的风险评估，包括风险分析和风险控制措施。

临床评估文件：根据产品的风险等级和适用性，进行临床评估并提供相应的临床数据。

质量管理体系文件：提交相关的质量管理体系文件，如ISO 13485认证证书、质量手册、程序文件和内部审核报告等。

标签和说明书：提供产品的标签和使用说明书，确保符合欧洲MDR的标签和包装要求。

追溯能力文件：提供产品的追溯能力文件，包括供应链管理和产品追踪记录等。

委托认证机构进行评估：选择合适的认证机构，委托其对技术文件进行评估，并进行相关的测试和审核。

准备技术文件和申请：根据认证机构的要求，准备完整的技术文件，并向认证机构提交申请。

认证评估和审核：认证机构将对技术文件和申请进行评估和审核，包括对技术规格、风险评估、临床数据和质量管理体系等方面的审查。

发放CE认证：如果申请通过认证机构的审核，将获得欧洲MDR CE认证，获得CE标志并发放相应的证书。