要申请美国FDA认证（即510(k)或PMA），使立体定向手术计划软件合法在美国市场上销售和使用，您需要遵循以下一般性的步骤和程序：

了解FDA的要求： 确保您充分了解FDA对立体定向手术计划软件的认证要求和相关规定。可以参考FDA的官方 网站，查阅有关的法规和指南文件。

收集技术资料： 准备立体定向手术计划软件的详细技术资料，包括软件架构、功能描述、算法说明等。

比较现有产品： 查找类似的已获得FDA认证的立体定向手术计划软件，进行比较研究，了解类似产品的认证路径和经验。

确定适用的认证途径： 根据您的软件特性，确定适用的认证途径，是通过510(k)途径还是需要进行PMA申请。

提交预申请（可选）： 如果您选择PMA途径，可以考虑提交预申请，以便FDA提供初步的意见和建议。

准备申请材料： 根据选定的认证途径，准备相应的申请材料，包括申请表格、技术文件、性能测试数据、临床数据（如果适用）等。

提交申请： 将准备好的申请材料提交给FDA。对于510(k)，提交前需要注册用户账号，通过FDA电子提交门户（eSubmitter）或电子注册和报告系统（eSTAR）进行在线提交。对于PMA，需要在FDA电子提交门户（eSubmitter）或电子注册和报告系统（eSTAR）创建账号并提交材料。

等待审查： FDA将对您的申请进行审查。审查过程可能需要一段时间，您可能需要与FDA进行进一步的沟通和回复。

获得认证： 如果您的申请获得批准，您将收到FDA的认证通知，即510(k)许可证或PMA批准函。

市场上市： 获得认证后，您可以将立体定向手术计划软件合法上市并在美国市场销售和使用。