新加坡卫生科学局（HSA）对三类医疗器械的注册流程相对复杂，因此其注册难度较高。以下是导致三类医疗器械注册难度较高的几个主要原因：

临床评估要求：三类医疗器械的注册通常需要进行临床评估，以验证产品在实际临床应用中的安全性和有效性。这意味着厂商需要进行大规模的临床研究，收集并提交丰富的临床数据。临床评估的过程复杂、耗时，需要投入大量的人力、物力和财力资源。

技术评估复杂性：HSA对三类医疗器械的技术评估要求较高，需要对产品的设计、性能、材料、生产工艺等方面进行深入审查。此外，HSA还会对临床数据进行评估，以验证产品的安全性和有效性。这些技术评估的复杂性增加了注册的难度。

临床风险管理要求：三类医疗器械的临床使用风险较高，因此HSA对临床风险管理的要求也较高。厂商需要制定和执行严格的临床风险管理计划，包括风险分析、评估和控制措施等。临床风险管理计划的制定和执行需要投入大量的精力和资源。

现场审核可能性：对于某些高风险或关键性的三类医疗器械，HSA可能要求进行现场审核，对生产设施、质量管理体系和产品制造过程进行实地检查。现场审核需要厂商提供充分的准备，并且可能会增加注册过程的复杂性和时间成本。

法规和标准要求：三类医疗器械的注册需要符合更加严格的法规和标准要求，包括新加坡和国际相关的法规、ISO标准等。厂商需要花费更多的时间和精力来确保注册申请符合这些要求。

综上所述，三类医疗器械的注册难度较高，需要厂商投入大量的时间、资源和精力来满足HSA的要求。厂商应认真评估产品的注册可行性，并在注册过程中充分准备，积极配合HSA的审核和评估工作，以确保医疗器械能够顺利通过注册并投放市场。