医疗器械菲律宾FDA认证的申请提交流程通常包括以下几个主要步骤，企业需要按照流程逐步完成，并确保提交的申请文件符合菲律宾FDA的要求：

准备申请资料： 首先，企业需要准备医疗器械认证申请所需的所有资料和文件，包括申请表格、产品资料、质量管理体系文件、临床试验报告、技术文件等。确保所有资料完整、准确，并符合菲律宾FDA的要求。

填写申请表格： 根据菲律宾FDA提供的申请表格，企业需要填写相关信息，包括企业信息、产品信息、质量管理体系信息等。填写过程中要确保信息的准确性和完整性。

提交申请资料： 将准备好的申请资料提交给菲律宾FDA，可以通过邮寄、电子邮件或在线申请系统进行提交。在提交过程中，要确保资料的完整性和及时性，以避免延误审查进程。

初步审核： 菲律宾FDA收到申请资料后，会进行初步审核，检查资料的完整性和符合性。如果资料不完整或有缺漏，菲律宾FDA会要求企业补充或修改资料。

技术评估： 完成初步审核后，菲律宾FDA会对申请的医疗器械产品进行技术评估，包括对产品的设计、性能、安全性、有效性等方面进行评估和审查。

现场审查： 在技术评估的基础上，菲律宾FDA可能会安排对企业的生产现场进行实地审查，检查企业的生产设施、质量管理体系等是否符合要求。

审批决定： 完成技术评估和现场审查后，菲律宾FDA会根据评估结果和审查情况作出审批决定，决定是否批准医疗器械产品的认证申请。

颁发认证证书： 如果申请获得批准，菲律宾FDA会颁发医疗器械认证证书给企业，证明产品符合菲律宾的法规和质量标准。

总的来说，医疗器械菲律宾FDA认证的申请提交流程涉及申请资料准备、提交申请、初步审核、技术评估、现场审查、审批决定和颁发证书等多个环节。企业需要按照流程逐步完成，并确保资料的准确性和符合性，以提高认证申请的成功率。