菲律宾FDA对三类医疗器械的注册周期通常比一类和二类医疗器械更长，因为三类医疗器械具有较高的风险等级，可能涉及对人体内部的植入、介入或治疗功能。以下是一般情况下菲律宾FDA三类医疗器械注册的主要步骤和周期：

准备申请材料：申请人需要准备完整的注册申请材料，包括产品信息、技术文件、质量管理体系文件、临床数据、生产工厂信息、标签和包装信息等。由于三类医疗器械的复杂性和风险等级较高，这些文件通常需要更为详尽和充分地描述医疗器械的设计、功能、安全性和有效性等方面。

递交注册申请：将准备好的注册申请材料递交给菲律宾FDA，并支付相关的注册申请费用。菲律宾FDA通常会在数周至数月内对申请文件的完整性和合规性进行初步审核。

审核和评估：菲律宾FDA将对递交的注册申请进行审核和评估，包括对产品信息、技术文件、质量管理体系、临床数据、生产工厂等方面进行严格审查。由于三类医疗器械的复杂性和风险等级较高，此阶段的时间通常较长，可能在18个月到36个月之间。

现场审核（如果需要）：根据医疗器械的特性和风险等级，菲律宾FDA可能会要求进行现场审核。现场审核的时间通常在数天至数周之间。

审核结果通知：一旦审核完成，菲律宾FDA将向申请人发出审核结果通知。如果注册申请获批准，将颁发注册证书；如果存在问题或需要进一步提供信息，可能会要求申请人作出调整或补充。此阶段的时间通常在数周至数月之间，取决于菲律宾FDA对申请文件的最终审查和确认。

综上所述，菲律宾FDA三类医疗器械注册的周期通常在18个月到36个月之间，但具体时间取决于申请人准备材料的充分性、审核工作的繁忙程度以及菲律宾FDA的审批流程。为了确保医疗器械能够顺利通过注册审批，申请人需要提前准备充分，并积极配合菲律宾FDA的审核工作。