步骤一：决定申请。根据FSC要求，森林所有者决定申请对他的经营者进行认证，并选择信任认证机构。依据森林所有者的信息，认证方可以判断成功的期望值。

步骤二：签订合同。要求认证和被认证方签订合同。在签订合同前开展有关森林经营、森林经营认证过程以及课程的讨论。

步骤三：预评估。通常认证人员进行森林经营活动的预评估。这使认证人员初步了解森林经营活动的结构、管理和环境。而且森林所有者更熟识认证人员的要求。预评估的目的，就是要在主评估前从森林管理者那里进一步了解认证的森林面积。此外还有助于认证人员更有效的开展评估，所以需要咨询一些相关的人员。

步骤四：审阅管理文件。为了是认证人员了解完善的森林计划和管理过程的特点，森林所有者要事先提供为正式评估所需要的重要文件。这是节约时间和有效正式评估的需要。

步骤五：正式评估。当在预评估不合格的方面被解决，，即可以计划公司的现场评估。对于已经建立森林认证（FSC）标准的国家，该标准既成为评价的基础。对于还没有制定森林认证（FSC）标准的国家，认证机构将使用被批准的、并做了适应性修的森林认证标准。森林认证的基础不市森林的目前状态，而是通过不断的定期监测来控制森林经营的质量。在评估期的所有活动包括：森林经营管理基础、人员和详细的计划文件以及有关人员的座谈。然后，与项目主管讨论评估的结果。依据评估的结果，认证人员起草一份报告，包括建议的认证结果或为克服不足而提出的修改意见。

步骤六：复评估。认证报告将由2-3名独立的公认的专家复评。他们将对认证机构的工作和报告进行评估，并将评估结果提交认证决策委员会作最后评估。

步骤七：发证和注册。假如以上步骤给出了积极的评价结果，森林企业将被授予合格证书。如有必要，可以附加在一定时间前必须满足的条件。要严格控制用认证从事的市场活动和森林认证标志作为注册商标的活动。

步骤八：定期审核。在规定的时间（一般一次/一年），为了检查经营是否持续符合标准，认证人员进行一次短暂的和实地的森林经营活动审查。

认证的过程需要好几个月。时间主要取决于排除不足条件数量。与评估一般需要1-2天。正式评估则需要2-14天，这取决于企业规模和复杂程度。上述描述的步骤只是森林经营认证，并仅对“森林”本身有效。对使用经森林经营认证的林木，生产、销售带有FSC标识的产品，还需进行产销监管链认证。