目前我无法提供吉尔吉斯斯坦NSM注册证申请的具体流程，也无法确认是否可以在线提交申请。通常来说，医疗器械注册证的申请通常需要通过特定的注册机构或相关部门进行提交。这些机构可能会提供在线申请系统，但也可能要求申请人以书面形式提交申请。

如果您有意向申请吉尔吉斯斯坦NSM注册证，建议您直接联系吉尔吉斯斯坦国内的医疗器械注册机构或相关部门，咨询他们关于注册申请的具体流程、要求以及是否可以在线提交申请的相关信息。这样可以确保您获得最准确、最及时的信息，并了解如何正确地进行注册申请。