在MDR法规下，医疗器械的CE认证办理流程与原来的CE认证流程有所不同。以下是一般的流程：

确定产品分类：首先需要确定医疗器械的分类，并查阅相关的技术文件，以确定是否需要进行CE认证。

选择认证机构：根据产品的分类和适用的标准，选择合适的认证机构进行认证。认证机构需要被欧洲委员会认可，并符合ISO/IEC 17065标准。

编制技术文件：根据CE认证要求，编制技术文件，包括技术说明书、产品说明书、质量保证文件等。

进行风险评估：对医疗器械进行风险评估，以确定产品的风险等级。

进行性能测试：根据适用的标准，对医疗器械进行性能测试。

进行审核：认证机构将对技术文件进行审核，并检查是否符合相关的标准和法规。

发放证书：审核通过后，认证机构会向申请人发放CE认证证书，并在产品上贴上CE标志。

请注意，以上流程仅供参考，具体的认证流程可能因产品类型、认证机构等因素而有所不同。

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