医用高频除颤仪的CE认证申请流程如下：

1. 找到一家符合要求的认证机构，可以在欧盟公布的认证机构数据库中查询；

2. 根据认证机构提供的要求，准备相应的文件材料，包括技术文件、产品说明书、产品测试报告等；

3. 申请进行初步评估，评估包括技术文件审查和产品样品测试；

4. 如果初步评估合格，可以申请进行工厂检查，确认生产过程符合相关要求；

5. 完成所有评估和检查后，如果认证机构确认产品符合相关要求，将颁发CE认证证书。

需要注意的是，医疗器械CE认证是在欧盟境内销售使用的必要条件，申请人需要确保产品符合欧盟相关法规和标准。此外，申请人需要承担相关费用和可能的时间成本。

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