飞秒激光角膜屈光治疗机的巴西ANVISA认证申请流程包括以下步骤：

1. 准备资料： 收集需要的申请资料，包括产品说明、技术文档、质量管理体系文件、设备验证报告等。

2. 选择认证机构： 选择一家合格的认证机构，可以是国内的认证代理或专 业的认证咨询机构，以协助您进行认证申请。

3. 申请准备： 与认证机构合作，准备申请所需的文件和材料，确保其符合ANVISA的要求。

4. 申请递交： 将准备好的申请文件递交给认证机构，他们将协助您提交申请到ANVISA。

5. 文件审核： ANVISA将对申请文件进行审核，确保其完整性和合规性。

6. 审查和现场检查： 根据产品的风险等级，ANVISA可能会进行文件审核和现场检查。如果需要现场审查，您需要准备好接待审查人员并展示生产现场。

7. 审查结果： ANVISA将评估您的申请文件和现场检查结果，作出是否批准认证的决定。

8. 获得认证： 如果您的申请获得批准，您将获得巴西ANVISA认证，可以合法在巴西市场销售您的产品。

9. 更新和维护： 持续保持质量管理体系，遵循ANVISA的要求，定期更新认证，确保产品持续合规。