在MDR（欧洲医疗器械监管法规）中，一次性使用无菌注射器的CE认证办理周期会因多种因素而有所差异，包括产品的特殊性、申请人准备文件的时间、认证机构的工作负荷以及可能的补充要求等。因此，无法给出确切的办理周期。

一般情况下，一次性使用无菌注射器的CE认证办理周期通常会持续数个月到一年不等。这个时间包括了申请准备、技术评估、审核和决策等阶段所需的时间。

申请人准备充分、提供完整的技术文件，并与认证机构积极合作，可以加快整个办理周期。此外，根据MDR法规，认证机构有一定的时间限制来完成评估和决策，通常为90天。然而，实际的办理周期还会受到监管机构的工作负荷和其他不可预测的因素的影响。

对于具体的时间估计和办理周期，建议与目标市场的医疗器械监管机构或专业的认证机构进行详细咨询和沟通，以获取准确的信息。

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