吉尔吉斯斯坦NSM注册证的适用性是否涵盖平行进口的医疗器械，取决于吉尔吉斯斯坦国家药品和医疗器械管理机构（NSM）的规定和法律法规。

平行进口器械是指在一个国家合法销售的医疗器械，通过非官方渠道引入另一个国家，并在该国家市场上进行销售。由于平行进口的医疗器械通常已在原产国获得了注册或许可，因此在目标国家可能需要符合一定的要求或程序来确保其在目标国家市场上合法销售和使用。

如果吉尔吉斯斯坦的法规允许平行进口器械，并且规定平行进口器械需要获得吉尔吉斯斯坦NSM注册证才能在该国市场上合法销售和使用，那么平行进口器械可能需要进行注册并获得吉尔吉斯斯坦NSM注册证。具体情况还需参考吉尔吉斯斯坦相关的法规和政策，以确定平行进口器械是否需要进行注册以及所需的程序和要求。

如果您计划进行平行进口医疗器械的销售，建议您详细了解吉尔吉斯斯坦的相关法规和NSM的要求，并在申请前与当地的注册机构或相关部门进行沟通，以确保您的操作符合法律法规和政策要求。