根据MDR法规，热成像仪作为医疗器械需要进行CE认证。具体申请流程如下：

1. 确认热成像仪的分类和适用标准：根据热成像仪的设计用途和特性，确定其对应的分类规则以及适用的欧洲标准（EN）或标准（ISO）。

2. 进行风险评估：根据热成像仪的设计用途和特性，进行风险评估，制定风险控制措施和技术文件，包括产品说明书、操作手册、技术细节等。

3. 进行性能测试和验证：对热成像仪进行性能测试和验证，确保其符合适用标准和规定的性能要求。

4. 委托认证机构进行CE认证：将准备就绪的技术文件和测试验证报告提交给认证机构，由认证机构进行审核和认证。在通过认证后，可以在产品上标注CE标志并发行CE证书。

需要注意的是，CE认证是一个比较复杂的过程，需要有相关的技术和法规知识，因此建议企业可以委托专业的机构或顾问来进行CE认证申请。

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