械字号备案申请被拒绝的原因可能有多种，以下是一些常见的原因：

1. 提交材料不完整或不符合要求：械字号备案需要提供一系列相关材料和文件，如果提交的材料不完整或者不符合要求，可能会导致申请被拒绝。

2. 医疗器械不符合法规要求：械字号备案的医疗器械必须符合国家相关法规和标准要求。如果医疗器械不符合法规要求，申请将被拒绝。

3. 申请企业不符合资质要求：械字号备案要求申请企业具有一定的资质和合法经营资格。如果申请企业不符合相关要求，申请将被拒绝。

4. 申请材料虚假或不实：如果申请材料中包含虚假信息或者不实信息，申请将被拒绝。

5. 医疗器械不符合技术要求：械字号备案的医疗器械需要符合一定的技术要求和性能标准。如果医疗器械不符合技术要求，申请将被拒绝。

6. 其他法规违规行为：如果申请企业或医疗器械涉嫌违反其他相关法规，申请也可能被拒绝。

申请械字号备案是一项复杂的过程，申请人需要仔细了解相关法规和要求，并确保提供的材料和信息真实、合法、完整。如果遇到拒绝，申请人可以根据拒绝原因进行调整和改进，并重新提交申请。